凭此兵威，赵禹率领大军兵犯苏州，而方国珍也彻底投靠了赵禹。张士诚力不能敌，自缚出城投降，原本正在筹划的屠狮大会也不了了之。谢逊成功被解救出来，而屠龙刀却下落不明。各派武林人士仍然不肯顺服，灭绝师太当众宣布了刀剑之中的秘密，于是各派人士纷纷出海，寻找屠龙刀的下落，寄望以此来打败魔君。
平定江南之后，赵禹命徐达常遇春兴兵北伐，而此时元廷大军仍陷入混战之中，根本无力抵抗。北伐大军势如破竹，一路杀入大都城中，传承百年的大元国祚就此覆灭！
元帝等一干蒙古贵人们仓皇逃亡上都，徐达常遇春北伐大军一路追击。而在将近上都时，常遇春旧疾复发，姓命危在旦夕，赵禹携医仙胡青牛奔赴上都，救下常遇春，同时擒获未及逃远的元帝，将之押回应天。
是年，赵禹正式在应天登基为帝，国号大明。于此同时，王保保拥戴元廷太子登基为帝，重建大元，一路往西而去。
新朝第二年，失踪数年之久的殷野王等人终于回到中土，并且带来一个震惊世人的消息。他们漂泊海外，一路往东行去，竟然发现一片丰饶广袤的土地。那片土地地广人稀，无比肥沃，同时生长着无数在中土不曾出现的物种。块茎肥大的番薯，颗粒**、形如珍珠黄玉的蕃米……
这个消息令新朝上下震荡无比，赵禹更是亲自参与到进贤院对于新物种的研究中。为了更清晰了解那块新土地，赵禹命令殷野王等人将自己一路行进路程详细记录下来，刊行天下，鼓励民间前去探索。对于财富土地的渴望，整个新朝掀起了远航的热潮，然而由于路程着实太过遥远，茫茫大海中天灾[***]不断，无数人葬身在海洋中，然而也有一些运气好到了极点的人终于到达海洋的彼岸，那块富饶无比的广阔大陆，并且收集那些罕见物种，返回中土，获得惊人的封赏厚赐！
新的物种研发进度喜人，许多农作物已经成功在中土种植下来。而这其中，尤以元朝废帝这位鲁班天子的研究最为惊人。他竟借助新大陆带回的一种树胶设计出不须人力划动，只凭借沸水热气推动便能自动行驶的龙舟！
元帝将此奇物进献朝廷，赵禹大喜过望，册封元帝为王，准其世代传承，非谋国之逆不得废除。有此榜样，整个大明新朝掀起格物致知的狂热浪潮！
正当一切欣欣向荣时，阴霾却在渐渐逼近。新大陆的据点上突然出现红皮肤土著人，那些人骁勇善战，甫一接触便给了大明子民迎头痛击，损失惨重，只有一些身负武功之辈存活下来，并且将消息传递回来。赵禹大怒，欲要兴兵讨伐却被群臣劝阻，无奈下只能号召民间江湖人士前往新大陆。为了缓和正道武林与新朝的矛盾，张三丰百岁高龄自告奋勇，率领一干武林高手出海远洋。赵禹亲自送行，并册封张三丰为护国法师，许武当派世代传承。
随着往来中土与新大陆的人越来越多，江南却突然爆发瘟疫，无数人因此身亡。赵禹紧急召集天下名医商讨救治之法，终于在五毒教蓝教主和医仙胡青牛的帮助下，寻找到医治恶疾的良策，将瘟疫完全清除。
大明开国二十一年，明皇赵禹壮年驾崩，太子赵方即位为帝。新朝伊始，国舅王保保自缚归朝，愿举西元一国为藩篱，请求大明出兵救助危在旦夕的西元。新皇征召西域胡虏壮士，组建远征军，讨伐窃据察合台汗位的帖木儿王，并于花剌字模国彻底击溃帖木儿。由是，西域南洋万国来朝，共尊明皇为新成吉思汗！
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